English
Klaster etfos
Poštovani!
U našoj ustanovi u sklopu tehnologijskog projekta CRO-GRID je postavljen klaster distribucije Rocks zasnovan na Linux Red Hat distribuciji. Zainteresirani koji imaju zahtjeve za bržom i opsežnom obradom svojih aplikacija koje zahtijevaju veliku moć računala od sada mogu koristiti ovu klastersku distribuciju.
Stoga, pozivamo zainteresirane istraživače ili grupe da nam se pridruže u podprojektu Aplikacija ili da prijave novi tehnologijski projektni zadatak u okviru tog podprojekta. Molim zainteresirane da nam se jave na adresu klaster@etfos.hr ili na telefon 031/224-602 (ured dekana).
U daljnjem tekstu dani su općeniti podaci o našem klasteru.
Što je klaster?
Računalnim klasterom obično smatramo sustav računala umreženih korištenjem brze lokalne mreže (LAN) pomoću koje računala međusobno komuniciraju . Korištenje specifične programske podrške daje visok stupanj integracije računala, omogućava njihov koordinirani zajednički rad i pretvara ih efektivno (u mjeri u kojoj je to fizički moguće) u jedinstven višeprocesorski sustav. Neizbježna heterogenost arhitekture te korištenje distribuirane (umjesto podijeljene) memorije jedino je po čemu se klaster razlikuje od jedinstvenog višeprocesorskog sustava.
Ciljevi povezivanja računala u klastere su razni, a najčešće se računala povezuju s ciljem osiguravanja veće pouzdanosti ili većih performansi u odnosu na pojedino računalo.
Rocks
Distribucija klastera NPACI Rocks sadrži sve bitne programske komponente za ostvarenje klasterskog sustava. Pored operacijskog sustava (RedHat Enterprise Linux 3.0) Rocks distribucija sadrži i ostale elemente koji omogućavaju izvedbu klastera:
- biblioteke za prijenos poruka koje omogućavaju distribuirano/paralelno izvođenje aplikacija - MPI, PVM, LAM
- sustav za raspodjelu resursa (scheduling) i raspoređivanje procesa (batching) - SUN Grid Engine 5.3
- paralelni datotečni sustav, koji je namijenjen brzoj pohrani velike količine podataka - PVFS
- sustav za nadzor klastera - Ganglia
- sustav za brzu instalaciju i izvedbu - Anaconda
- bazu podataka u kojoj se smještaju svi podaci nužni za rad i konfiguraciju klastera
- mrežne servise nužne za funkcioniranje klastera (NTP, 411, NFS, i druge).
RedHat Linux na kojem je bazirana Rocks distribucija zasnovan je na RPM (Redhat Package Manager) paketnom sustavu.
Većina znanstvenih aplikacija distribuira se u RPM formi, a druge programske pakete moguće je (relativno jednostavno) pretvoriti u RPM paket. Za pakete koji traže dodatnu prilagodbu našim potrebama, sustav ROCKS omogućuje definiranje parametara za instalaciju pojedinih paketa, te dodavanje skripti koje se izvršavaju prije i poslije instalacije pojedinog paketa (npr. podešavanje konfiguracijskih fileova tog paketa našim potrebama).
AKTUALNI PROJEKTI I KORISNICI
Računalni klaster Isabella (Srce) danas koristi 20 projekata i 60-tak korisnika. Projekti koji se trenutno odvijaju na Isabelli su (sortirani po abecedi):
Analitički sustavi - razvoj pristupa i metoda
Dinamička svojstva i spektroskopija površina i nanostruktura
Distribuirani algoritmi kombinatorne optimizacije
Enzimske transformacije saharida i kinuklidina
Fizikalna svojstva djelomično uređenih molekulskih sustava
Intermetalni spojevi i metalni hidridi
Karbokationski međuprodukti u biosintezi steroida i triterpena
Kemijska reaktivnost i femtosekundni procesi
Kvantitativne metode u prometu
Kvantna teorija informacija
Masivni neutrini i astročestice
Modeliranje novih ugljikovih materijala
Numerička analiza kvazi krtih materijala
Prošireni pi-sistemi i molekularne spektroskopije
Protonski afiniteti i reakcije prijenosa protona u kemiji
Proučavanje viskoenergijskog kozmičkog gama zračenja na opservatoriju CROATEA
Reaktivni međuprodukti u osnovnom i pobuđenom stanju
Reaktivnost i reakcijski mehanizmi
Struktura i dinamika (bio)molekula
Teorija kritičnih pojava i modeliranje u sustavima mnoštva čestica
Pozivamo zainteresirane istraživače ili grupe da nam se pridruže u podprojektu Aplikacija ili da prijave novi tehnologijski projektni zadatak u okviru tog podprojekta. Molim zainteresirane da nam se jave na adresu:
- klaster@etfos.hr ili
- na telefon 031/224-602 (ured dekana).
Linkovi
- Sveučilišni računski centar, Sveučilište u Zagrebu
- Fakultet elektrotehnike, strojarstva i brodogradnje, Sveučilište u Splitu
- Institut Ruđer Bošković
- Rocks Cluster Distribution
- RedHat Linux
- CRO-GRID
- CERN-ov Grid Cafe Computational Clusters - Općenito o računalnim klasterima, linkovi na programske distribucije, alate i biblioteke.
- Beowulf Cluster Site - Povijest, komercijalna distribucija Scyld.
- What's in NPACI Rocks and How Do I Use It? - Rocks iz perspektive jednog korisnika - instalacija, upute za korištenje, iskustva.
- Linux High Performance Technical Computing (LinuxHPC.org) - Portal posvećen primjeni Linuxa za High Performance Computing - vijesti, linkovi.
- Linux Magazine - Extreme Linux - Zanimljivi članci iz "Linux Magazine" posvećeni klasterima i HPC-u.
- Analiza klasterskih tehnologija - CRO-GRID - Analiza klasterskih tehnologija za potrebe projekta "CRO-GRID Infrastruktura"
U našoj ustanovi u sklopu tehnologijskog projekta CRO-GRID je postavljen klaster distribucije Rocks zasnovan na Linux Red Hat distribuciji. Zainteresirani koji imaju zahtjeve za bržom i opsežnom obradom svojih aplikacija koje zahtijevaju veliku moć računala od sada mogu koristiti ovu klastersku distribuciju.
Stoga, pozivamo zainteresirane istraživače ili grupe da nam se pridruže u podprojektu Aplikacija ili da prijave novi tehnologijski projektni zadatak u okviru tog podprojekta. Molim zainteresirane da nam se jave na adresu klaster@etfos.hr ili na telefon 031/224-602 (ured dekana).
U daljnjem tekstu dani su općeniti podaci o našem klasteru.
Što je klaster?
Računalnim klasterom obično smatramo sustav računala umreženih korištenjem brze lokalne mreže (LAN) pomoću koje računala međusobno komuniciraju . Korištenje specifične programske podrške daje visok stupanj integracije računala, omogućava njihov koordinirani zajednički rad i pretvara ih efektivno (u mjeri u kojoj je to fizički moguće) u jedinstven višeprocesorski sustav. Neizbježna heterogenost arhitekture te korištenje distribuirane (umjesto podijeljene) memorije jedino je po čemu se klaster razlikuje od jedinstvenog višeprocesorskog sustava.
Ciljevi povezivanja računala u klastere su razni, a najčešće se računala povezuju s ciljem osiguravanja veće pouzdanosti ili većih performansi u odnosu na pojedino računalo.
Rocks
Distribucija klastera NPACI Rocks sadrži sve bitne programske komponente za ostvarenje klasterskog sustava. Pored operacijskog sustava (RedHat Enterprise Linux 3.0) Rocks distribucija sadrži i ostale elemente koji omogućavaju izvedbu klastera:
- biblioteke za prijenos poruka koje omogućavaju distribuirano/paralelno izvođenje aplikacija - MPI, PVM, LAM
- sustav za raspodjelu resursa (scheduling) i raspoređivanje procesa (batching) - SUN Grid Engine 5.3
- paralelni datotečni sustav, koji je namijenjen brzoj pohrani velike količine podataka - PVFS
- sustav za nadzor klastera - Ganglia
- sustav za brzu instalaciju i izvedbu - Anaconda
- bazu podataka u kojoj se smještaju svi podaci nužni za rad i konfiguraciju klastera
- mrežne servise nužne za funkcioniranje klastera (NTP, 411, NFS, i druge).
RedHat Linux na kojem je bazirana Rocks distribucija zasnovan je na RPM (Redhat Package Manager) paketnom sustavu.
Većina znanstvenih aplikacija distribuira se u RPM formi, a druge programske pakete moguće je (relativno jednostavno) pretvoriti u RPM paket. Za pakete koji traže dodatnu prilagodbu našim potrebama, sustav ROCKS omogućuje definiranje parametara za instalaciju pojedinih paketa, te dodavanje skripti koje se izvršavaju prije i poslije instalacije pojedinog paketa (npr. podešavanje konfiguracijskih fileova tog paketa našim potrebama).
AKTUALNI PROJEKTI I KORISNICI
Računalni klaster Isabella (Srce) danas koristi 20 projekata i 60-tak korisnika. Projekti koji se trenutno odvijaju na Isabelli su (sortirani po abecedi):
Analitički sustavi - razvoj pristupa i metoda
Dinamička svojstva i spektroskopija površina i nanostruktura
Distribuirani algoritmi kombinatorne optimizacije
Enzimske transformacije saharida i kinuklidina
Fizikalna svojstva djelomično uređenih molekulskih sustava
Intermetalni spojevi i metalni hidridi
Karbokationski međuprodukti u biosintezi steroida i triterpena
Kemijska reaktivnost i femtosekundni procesi
Kvantitativne metode u prometu
Kvantna teorija informacija
Masivni neutrini i astročestice
Modeliranje novih ugljikovih materijala
Numerička analiza kvazi krtih materijala
Prošireni pi-sistemi i molekularne spektroskopije
Protonski afiniteti i reakcije prijenosa protona u kemiji
Proučavanje viskoenergijskog kozmičkog gama zračenja na opservatoriju CROATEA
Reaktivni međuprodukti u osnovnom i pobuđenom stanju
Reaktivnost i reakcijski mehanizmi
Struktura i dinamika (bio)molekula
Teorija kritičnih pojava i modeliranje u sustavima mnoštva čestica
Pozivamo zainteresirane istraživače ili grupe da nam se pridruže u podprojektu Aplikacija ili da prijave novi tehnologijski projektni zadatak u okviru tog podprojekta. Molim zainteresirane da nam se jave na adresu:
- klaster@etfos.hr ili
- na telefon 031/224-602 (ured dekana).
Linkovi
- Sveučilišni računski centar, Sveučilište u Zagrebu
- Fakultet elektrotehnike, strojarstva i brodogradnje, Sveučilište u Splitu
- Institut Ruđer Bošković
- Rocks Cluster Distribution
- RedHat Linux
- CRO-GRID
- CERN-ov Grid Cafe Computational Clusters - Općenito o računalnim klasterima, linkovi na programske distribucije, alate i biblioteke.
- Beowulf Cluster Site - Povijest, komercijalna distribucija Scyld.
- What's in NPACI Rocks and How Do I Use It? - Rocks iz perspektive jednog korisnika - instalacija, upute za korištenje, iskustva.
- Linux High Performance Technical Computing (LinuxHPC.org) - Portal posvećen primjeni Linuxa za High Performance Computing - vijesti, linkovi.
- Linux Magazine - Extreme Linux - Zanimljivi članci iz "Linux Magazine" posvećeni klasterima i HPC-u.
- Analiza klasterskih tehnologija - CRO-GRID - Analiza klasterskih tehnologija za potrebe projekta "CRO-GRID Infrastruktura"